Esta iglesia tiene la inusual particularidad de que se localiza dentro del panteón de Real de Catorce. Fue construida para enterrar a la vez dentro de un templo y de un camposanto a los fallecidos más notables del pueblo y en su interior hay 70 tumbas de gente acaudalada, sacerdotes y otros ilustres catorceños. El templo de la Virgen de Guadalupe fue el primer albergue de la imagen de San Francisco de Asís, ahora situada en la Parroquia de la Purísima Concepción. A un lado de la iglesia hay una capilla muy antigua que era utilizada para velar los cuerpos antes de los entierros.

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