Como su nombre lo indica, forma parte de las instalaciones de la Casa de las Artesanías con sede en Estación Creel. El inmueble que lo alberga fue construido como estación de trenes en 1956 y remodelado en 1996, bajo el proyecto del arquitecto Guillermo Lozano. Abrió sus puertas como museo el 13 de junio de 1998. Su objetivo es dar a conocer los tópicos esenciales de la cultura prehispánica de la región, a través de diversos elementos relacionados con la etnografía, el arte popular y la historia.
El museo cuenta con las siguientes salas permanentes:
1. Encuentro de dos mundos (mestizo y prehispánico)
2. Costumbres y tradiciones del grupo tarahumara
3. Medicina tradicional y ceremonias religiosas
4. Sala de exposición fotográfica viaje al país de los tarahumaras, del francés Gerard Tournebize
Destacan sus colecciones de vasijas de barro, textiles, objetos de madera y fotografías de los primeros ferrocarriles y de la casa del señor Enrique Creel.

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