El Colegio Noviciado de San Francisco Javier y su templo representan una de las obras barrocas del siglo XVIII más representativas de nuestro país, que a su vez lo convierten en uno de los museos más importantes del México actual.
Su labor es investigar, promover y difundir la cultura del virreinato de la Nueva España, así como conservar y exhibir el edificio y los objetos que resguarda.
El Museo Nacional del Virreinato es uno de los más importantes de México. Ofrece al público visitante las exposiciones permanentes El México colonial, Conquista, Primera sociedad colonial, Integración de la Nueva España, Reformas borbónicas y la crisis de la sociedad colonial, Comercio con Oriente, Talleres conventuales, Gremios novohispanos y Monjas coronadas. Vida conventual femenina.
El Colegio de San Francisco Javier, nombre original de este museo, fue fundado en 1586 con el propósito de instruir y formar a los jóvenes novicios que ingresaban a la Compañía de Jesús. Tras la expulsión de los jesuitas por órdenes del rey Carlos III, el inmueble quedó abandonado hasta que en 1774 fue cedido al clero secular para fundar el Colegio de Instrucción, Retiro Voluntario y Corrección. En 1885 los jesuitas volvieron a ocupar el lugar, pero durante la Revolución, en el año de 1914, de nuevo fueron expulsados. Es hasta 1933 que el recinto fue nacionalizado y clasificado como monumento histórico. En 1964 fue restaurado e inaugurado como Museo Nacional del Virreinato, con el objeto de albergar, conservar y difundir los bienes históricos y culturales de dicho periodo.

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