A pesar de que este templo del Barrio de Santa María tiene nombre mariano, es más famoso por su Cristo Negro, una de las imágenes de Jesús más veneradas en todo México. La tradición de los cristos negros nació en Mesoamérica a finales del siglo XVI, cuando el ahora célebre Cristo Negro de Esquipulas, Guatemala, fue tallado en una madera que se tornó de color negro con el paso de los años. La historia del Cristo Negro de Ahuacatlán es un poco distinta; un incendio arrasó con la antigua capilla que lo albergaba y la imagen quedó milagrosamente intacta, pero se había oscurecido por la humareda. En el interior de la iglesia hay también 4 grandes pinturas alusivas a las leyendas en torno al Cristo Negro.

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