La capilla primitiva del Señor de Nenthé que había sido erigida en 1702, fue demolida en 1943 después de ser destruida a finales de los años 1920 durante la Guerra Cristera. El nuevo santuario fue levantado en estilo arquitectónico moderno. Una de las leyendas en torno a la veneración del Señor de Nenthé dice que durante una severa sequía la capilla se incendió y la imagen del «Señor del Agua» fue encontrada intacta en un lugar donde brotaba un manantial. Otra leyenda señala que el Santo Cristo salvó milagrosamente a un soldado de las tropas independentistas en 1810. De cualquier forma, cuando las lluvias se demoran, los campesinos sacan la imagen en procesión, clamando por agua.

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